MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011981	GCG	2	6	351494	351499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102702
6002	NC_011981	GCG	2	6	351515	351520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102702
6003	NC_011981	CCAC	2	8	351537	351544	25 %	0 %	0 %	75 %	222102702
6004	NC_011981	CAG	2	6	351578	351583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102702
6005	NC_011981	ACC	4	12	351591	351602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102702
6006	NC_011981	CGC	2	6	351634	351639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102702
6007	NC_011981	ATA	2	6	351653	351658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102702
6008	NC_011981	GGC	2	6	351689	351694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102702
6009	NC_011981	TGA	2	6	351697	351702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102702
6010	NC_011981	GGC	2	6	351742	351747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102702
6011	NC_011981	CAG	2	6	351923	351928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102702
6012	NC_011981	GCA	2	6	351999	352004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102702
6013	NC_011981	CAA	2	6	352030	352035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102702
6014	NC_011981	GA	3	6	352107	352112	50 %	0 %	50 %	0 %	222102702
6015	NC_011981	CAG	2	6	352127	352132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102702
6016	NC_011981	AAT	2	6	352154	352159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102702
6017	NC_011981	CAG	2	6	352181	352186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102702
6018	NC_011981	TTG	2	6	352197	352202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102702
6019	NC_011981	GCA	2	6	352315	352320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102702
6020	NC_011981	CAT	2	6	352333	352338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102702
6021	NC_011981	GGA	2	6	352376	352381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102702
6022	NC_011981	GGC	2	6	352470	352475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102703
6023	NC_011981	GTT	2	6	352552	352557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102703
6024	NC_011981	GCA	2	6	352569	352574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102703
6025	NC_011981	GC	3	6	352595	352600	0 %	0 %	50 %	50 %	222102703
6026	NC_011981	TGA	4	12	352620	352631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102703
6027	NC_011981	GCC	2	6	352700	352705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102703
6028	NC_011981	ATG	2	6	352721	352726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102703
6029	NC_011981	CAG	3	9	352738	352746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102703
6030	NC_011981	CCG	2	6	352778	352783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102703
6031	NC_011981	GC	3	6	352850	352855	0 %	0 %	50 %	50 %	222102703
6032	NC_011981	TCA	2	6	352871	352876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102703
6033	NC_011981	CCA	2	6	352917	352922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102703
6034	NC_011981	CGC	2	6	353013	353018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102703
6035	NC_011981	GCCA	2	8	353053	353060	25 %	0 %	25 %	50 %	222102703
6036	NC_011981	CCA	2	6	353109	353114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102703
6037	NC_011981	TCT	2	6	353384	353389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102704
6038	NC_011981	GCC	3	9	353521	353529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102704
6039	NC_011981	CAA	2	6	353531	353536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102704
6040	NC_011981	TGC	2	6	353592	353597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102704
6041	NC_011981	CAT	2	6	353606	353611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102704
6042	NC_011981	GCC	2	6	353644	353649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102704
6043	NC_011981	CCG	2	6	353668	353673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102704
6044	NC_011981	GGC	2	6	353688	353693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102704
6045	NC_011981	AAC	2	6	353694	353699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102704
6046	NC_011981	GCC	2	6	353737	353742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102704
6047	NC_011981	TGG	2	6	353757	353762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102704
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6050	NC_011981	CCA	2	6	353924	353929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102704
6051	NC_011981	TAA	2	6	353977	353982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102704
6052	NC_011981	GCT	2	6	353986	353991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102704
6053	NC_011981	TGC	2	6	354057	354062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102704
6054	NC_011981	GCA	2	6	354064	354069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102704
6055	NC_011981	TTGCTG	2	12	354129	354140	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222102704
6056	NC_011981	GGCAGC	2	12	354315	354326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222102704
6057	NC_011981	CAT	3	9	354336	354344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102704
6058	NC_011981	A	7	7	354605	354611	100 %	0 %	0 %	0 %	222102705
6059	NC_011981	AAG	2	6	354617	354622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102705
6060	NC_011981	ACG	2	6	354623	354628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102705
6061	NC_011981	GAA	2	6	354697	354702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102705
6062	NC_011981	A	6	6	354729	354734	100 %	0 %	0 %	0 %	222102705
6063	NC_011981	CTG	2	6	354785	354790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102705
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6067	NC_011981	CTG	2	6	354959	354964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102705
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6072	NC_011981	CGT	2	6	355127	355132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102705
6073	NC_011981	A	6	6	355138	355143	100 %	0 %	0 %	0 %	222102705
6074	NC_011981	CTG	2	6	355175	355180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102705
6075	NC_011981	GGCG	2	8	355187	355194	0 %	0 %	75 %	25 %	222102705
6076	NC_011981	CGAT	2	8	355263	355270	25 %	25 %	25 %	25 %	222102705
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6079	NC_011981	CATT	2	8	355575	355582	25 %	50 %	0 %	25 %	222102705
6080	NC_011981	GCC	2	6	355588	355593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102705
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6088	NC_011981	CG	3	6	356442	356447	0 %	0 %	50 %	50 %	222102706
6089	NC_011981	ACA	2	6	356760	356765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102707
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6099	NC_011981	AG	3	6	357293	357298	50 %	0 %	50 %	0 %	222102707
6100	NC_011981	TGCTTG	2	12	357304	357315	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222102707
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6102	NC_011981	CCAGC	2	10	357395	357404	20 %	0 %	20 %	60 %	222102707
6103	NC_011981	CAAC	2	8	357502	357509	50 %	0 %	0 %	50 %	222102707
6104	NC_011981	CGA	2	6	357514	357519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102707
6105	NC_011981	CCGA	2	8	357569	357576	25 %	0 %	25 %	50 %	222102707
6106	NC_011981	CTG	2	6	357793	357798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102707
6107	NC_011981	TGG	2	6	357829	357834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102707
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6110	NC_011981	GGCG	2	8	358186	358193	0 %	0 %	75 %	25 %	222102708
6111	NC_011981	GGC	2	6	358316	358321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102708
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6115	NC_011981	TCG	2	6	358444	358449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102708
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6119	NC_011981	TTCC	2	8	358630	358637	0 %	50 %	0 %	50 %	222102708
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6121	NC_011981	GC	3	6	358711	358716	0 %	0 %	50 %	50 %	222102708
6122	NC_011981	CAT	2	6	358762	358767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102708
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6239	NC_011981	GT	3	6	366943	366948	0 %	50 %	50 %	0 %	222102715
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6242	NC_011981	GC	3	6	367057	367062	0 %	0 %	50 %	50 %	222102715
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6356	NC_011981	CT	3	6	373943	373948	0 %	50 %	0 %	50 %	222102722
6357	NC_011981	TGC	2	6	373950	373955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102722
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6359	NC_011981	GAAA	2	8	373974	373981	75 %	0 %	25 %	0 %	222102722
6360	NC_011981	TCGA	2	8	374020	374027	25 %	25 %	25 %	25 %	222102722
6361	NC_011981	CAT	2	6	374091	374096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102722
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6364	NC_011981	TCG	2	6	374205	374210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102722
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6484	NC_011981	TGC	2	6	383749	383754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102730
6485	NC_011981	TGC	2	6	383774	383779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102730
6486	NC_011981	CGGC	2	8	383781	383788	0 %	0 %	50 %	50 %	222102730
6487	NC_011981	CGT	2	6	383873	383878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102730
6488	NC_011981	AAGGC	2	10	383950	383959	40 %	0 %	40 %	20 %	222102730
6489	NC_011981	TCG	2	6	384067	384072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102730
6490	NC_011981	TGG	2	6	384129	384134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102730
6491	NC_011981	TTG	2	6	384251	384256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102731
6492	NC_011981	GCA	2	6	384300	384305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102731
6493	NC_011981	CGG	2	6	384399	384404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102731
6494	NC_011981	CGG	2	6	384462	384467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102731
6495	NC_011981	CTC	2	6	384468	384473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102731
6496	NC_011981	GCT	2	6	384499	384504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102731
6497	NC_011981	TCA	2	6	384536	384541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102731
6498	NC_011981	GCTG	2	8	384651	384658	0 %	25 %	50 %	25 %	222102731
6499	NC_011981	CGC	2	6	384702	384707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102731
6500	NC_011981	GCG	3	9	384718	384726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102731

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